Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLUP10909 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLUP10909 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLUP10909 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms