Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P0DMU3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P0DMU3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P0DMU3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms