Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms