Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms