Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBP07199 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBP07199 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms