Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTMAP06454 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTMAP06454 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTMAP06454 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTMAP06454 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTMAP06454 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTMAP06454 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTMAP06454 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTMAP06454 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTMAP06454 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTMAP06454 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTMAP06454 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTMAP06454 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTMAP06454 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTMAP06454 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms