Protein–RNA interactions for Protein: P05013

IFNA6, Interferon alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA6P05013 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA6P05013 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms