Protein–RNA interactions for Protein: P04180

LCAT, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCATP04180 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LCATP04180 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LCATP04180 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LCATP04180 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LCATP04180 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LCATP04180 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LCATP04180 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LCATP04180 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LCATP04180 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LCATP04180 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LCATP04180 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LCATP04180 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LCATP04180 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCATP04180 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LCATP04180 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms