Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms