Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms