Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LTAP01374 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LTAP01374 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LTAP01374 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTAP01374 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTAP01374 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTAP01374 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTAP01374 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTAP01374 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTAP01374 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTAP01374 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTAP01374 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTAP01374 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTAP01374 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTAP01374 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTAP01374 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTAP01374 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LTAP01374 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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