Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSD2O96028 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSD2O96028 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD2O96028 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD2O96028 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD2O96028 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD2O96028 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD2O96028 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD2O96028 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD2O96028 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD2O96028 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD2O96028 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD2O96028 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD2O96028 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD2O96028 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms