Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMDSO60547 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GMDSO60547 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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