Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNCRIPO60506 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms