Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms