Protein–RNA interactions for Protein: O43916

CHST1, Carbohydrate sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST1O43916 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHST1O43916 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHST1O43916 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHST1O43916 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms