Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ3O43525 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ3O43525 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ3O43525 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ3O43525 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ3O43525 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ3O43525 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ3O43525 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ3O43525 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KCNQ3O43525 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms