Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGSM2O43147 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms