Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGFO15240 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGFO15240 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGFO15240 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGFO15240 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms