Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms