Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD1AO15047 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD1AO15047 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms