Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRPO00591 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRPO00591 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRPO00591 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRPO00591 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRPO00591 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRPO00591 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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