Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms