Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
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