Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCTN6O00399 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms