Protein–RNA interactions for Protein: H7C417

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C417 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C417 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C417 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H7C417 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H7C417 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H7C417 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H7C417 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms