Protein–RNA interactions for Protein: G3V0Z9

LYNX1, HCG2043033, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1G3V0Z9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNX1G3V0Z9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNX1G3V0Z9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNX1G3V0Z9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNX1G3V0Z9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNX1G3V0Z9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNX1G3V0Z9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYNX1G3V0Z9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYNX1G3V0Z9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms