Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM247A6NEH6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 864.8 ms