Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms