Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EME2A4GXA9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms