Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms