Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms