Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms