Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HECTD4Q9Y4D8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HECTD4Q9Y4D8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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