Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms