Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPRKBQ9Y3C4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms