Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAB39Q9Y376 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms