Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms