Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF3AQ9Y2N7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms