Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms