Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPS5Q9UPZ3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms