Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms