Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF8Q9UPP1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms