Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC24A2Q9UI40 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC24A2Q9UI40 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms