Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms