Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms