Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT172Q9UG01 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms