Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms