Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms