Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAPAQ9P0L0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAPAQ9P0L0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms